שם הקורס: ביוכימיה: סוכרים, חלבונים ומטבוליזים דרכי הוראה: הרצאה נושאי לימוד: היקף הקורס: נשא הלימוד רמה נדרשת מספר עקרונות הביוכימיה. תפקיד המים לקיום החים. חומצות האמיניות,, י פפטידים,, י חלבונים,, י 0 אנזימים,, י 5 סוכרים,, י 6 לפידים 'דע,, י 60 מסלולים מטבוליים, הקורס מחולק לשני חלקים: I חלבונים, סוכרים וליפידים II אנזימים מטבוליזם חלבונים, סוכרים וליפידים I חלבונים א. החי. חשיבות ביומולקולות כהרכב של אורגניזם פרשיות הלימוד. עיקרונות הביוכימיה. תפקיד הביוכימיה במדעי החיים. המים לקיום החיים. מבנה כימי ותכונות של מים. ( ) מבנה וסיווג לפי תכונות של קבוצת. תפקיד ביולוגי של חלבונים. חומצות האמיניות : איזומריה של חומצות אמיניות. - קרבוקסילית ושל קבוצת ה- R. α - אמינית, α
pk a משוואת הנדרסון - הסלבך. טיטרציה של חומצות אמיניות. קביעת ה- וחישוב ה- PI של חומצות אמיניות חומציות, בסיסיות וניטרליות. הפרדה של חומצות ) אלקטרופורזה, אמיניות לפי ) כרומטוגרפיה על נייר, ( TLC מסיסות על ולפי מטען כרומטוגרפיה מחליפת יונים ). ) ). פפטידים. תפקיד ביולוגי של פפטידים. מבנה, נומנקלטורה. איפיון קשר פפטידי. סיווג פפטידים לפי הרכב החומצות האמיניות ולפי תכונות של ה R. חישוב מטען נטו של פפטידים. שיטות הפרדה של פפטידים לפי PI ולפי מטען נטו ) אלקטרופורזה, קולונה מחליפת יונים). שיטות לזיהוי הרכב הפפטיד ורצף של שרשרת פפטידית : הידרוליזה חומצית, הידרוליזה אנזימטית בעזרת אמינופפטידאז, קרבוקסיפפטידאז, טריפםין, כימוטריפםין. שיטות כימיות לזיהוי חומצות האמיניות הממוקמות בקצה אמיני - שיטת סנגר, שיטת אדמן. ( ).. חלבונים. פעילות ביולוגית. מבנה ראשוני. חלבונים פיברילריים. מבנה מרחבי: מבנה שניוני - α הליקס, מבנה - β, מבנה של קולגן (ספרספירלה). הקשרים המיצבים את המבנה השניוני. קרטין. סילסול. חלבונים גלובולריים - מבנה שלישוני ורביעוני. הקשרים המיצבים את המבנה השלישוני והרביעוני. מבנה ותפקיד של מיוגלובין והמוגלובין. עקומת דיסוציאציה, תופעת הקואופרטיביות אפקט בוהר. פתולוגיה של המוגלובין. שיטות הפרדה וניקוי של חלבונים : קביעת מיקום הקשרים דיסולפידיים, השקעה באמוניום סולפט, דיאליזה, הפרדת חלבונים לפי מסה מולרית ) כרומטוגרפיה מסננת מולקולרית ( וכרומטוגרפית זיקה הפרדת חלבונים לפי מטען ולפי מסה מולרית ) קולונה מחליף יונים, אלקטרופורזה נטיבית ואלקטרופורזה דנטורטיבית, השקעת חלבונים בנקודה האיזואלקטרית). דנטורציה ורנטורציה. ( ). סוכרים ב. מיון ומבנה של סוכרים לפי קבוצות קרבוניליות. נוסחאות פישר. תפקיד ביולוגי...,D L איזומריה של חד-סוכרים: סטראואיזומרים, ההסכם קונפיגורציה מוחלטת. האופטית. אפימרים. פעילות דיאסטרואיזומרים, אננטיומרים, תכונות כימיות של חד- סוכרים: חמצון, חיזור, חמצון-חיזור. ציקליזציה של חד-סוכרים (נוסחאות ). Haworth אנומרים. ניגזרות של חד -סוכרים. ) 6 ). אוליגוסוכרים: מבנה, נומנקלטורה. שיטות לזיהוי ההרכב של אוליגוסוכרים:. דו-סוכרים נפוצים. פרמתילציה, הידרוליזה חומצית והידרוליזה אנזימטית.
רב סוכרים נפוצים: עמילן, 6 ). צלולוז. ) לפידים הגדרה, מיון ותפקיד ביולוגי.. חומצות שומן רוויות ובלתי רוויות: מבנה, נומנקלטורה.. מס' תכונות פיזיקליות וכימיות של חומצות שומן רוויות ובלתי רוויות ) הסיבון, מס' היוד, פראוקסידציה). ) ).. טריגליצרידים: מיון, מבנה, נומנקלטורה. שמנים ושומנים. סבוניפיקציה ואינדיקציה עם יוד של שמנים ושומנים. קביעת הרכב הטריגליצרידים בעזרת מס' הסיבון ומס' היוד. ) ).. פוספוליפידים, ספינגולילידים (ספינגומיאלין) : מבנה, נומנקלטורה, תכונות פיזיקליות וכימיות. ) ). 5 גליקוליפידים וכולסטרול. ) ). ג. 0 אנזימים ומטבוליזם היקף הקורס: II א. אנזימים נושא הלימוד סיווג. ויסות פעולתם (שפעול זימוגנים, משוב, בקרה פיסיולוגית (שינוי תת יחידות). המרת צורות אנרגיה. אופן פעילות האנזים: שינוי באנרגיה החופשית במהלך הריאקציה, מצב המעבר, הפחתת אנרגיה ההפעלה. תצמיד אנזים סובסטרט: אתר פעיל, סוגי האינטרקציות בתצמיד, התאמה מושרית, התיאוריות של פישר וקושלנד. קינטיקה של ריאקציות כימיות וראקציות אנזימיות: סדר של ריאקציה, השפעת ריכוז הסובסטרט על קצב הריאקציה, מודל מיכאליס מנטן. קביעת ערכי רמה נדרשת,,,, מספר K M ו- Vmax, משואת לינוואר-ברג, משמעות ערכי K M ו- Vmax, מציאת
0 מספר המחזור ואורך מחזור קטליטי. עיכוב: סוגי עיכוב והשפעתם על הקינטיקה. אנזימים אלוסטריים: שתופיות, המודל המתואם ומודל הרצף, אנזימים אלוסטריים הומוטרופיים והטרוטרופיים, השפעת מודולטור חיובי או שלילי על,.K 0.5 ב. מסלולים מטבוליים פרשיות הלימוד נושא קשרים עשירים באנרגיה, סוגי העבודה בתא, מקורות האנרגיה בתא, עקרונות יסוד: מסלולים מטבוליים עיקריים (אנבוליים וקטבוליים). ביואנרגטיקה: חישובי שינויי אנרגיה חופשית. תוצרי הגליקוליזה ועלויות נקודות הבקרה בתהליך. תהליך הגליקוליזה. גליקוליזה: אנרגטיות של הגליקוליזה בתנאים אירוביים ואנאירוביים: יצירת לקטט, תסיסה כוהלית. תצמיד פירובט דהידרוגנז: תפקידו בתהליך הנשימה, ובקרת הריאקציה. מעגל קרבס: התהליכים ותרכובות הביניים במעגל. ריאקציות אנפלרוטיות. בקרה. שרשרת הנשימה, זרחון חמצוני, בקרה ועיכוב בשלבים השונים, התאוריה הכימואוסמוטית של מיטשל, מפרי צימוד, מאזני אנרגיה. גלוקונאוגנזה (יצירת גלוקוז מחדש): מקורות ליצירת גלוקוז, בקרה מתואמת של הגליקוליזה והגלוקונאוגנזה. גליקונאוגנזה וגליקוגנוליזה: יצירת ופירוק גליקוגן מ/לגלוקוז. פעולה משולבת של ההורמונים גלוקגון, אינסולין ואפינפרין בבקרת רמת הגלוקוז בדם. בקרה אלוסטרית. מטבוליזם השומנים: שפעול חומצות שומן, כניסתן למיטוכונדריה, חמצון חומצות שומן במעגל חמצון β (חומצה רוויה, לא רוויה, אי זוגית), חישובי אנרגיה. גופי קטו: יצירה, תפקיד ובקרה. בעיות רפואיות הקשורות למטבוליזם חומצות שומן. ביוסינטזה של חומצות שומן. מסלולים מטבוליים של חומצות אמינו: טרנסאמינציה ודאמינציה חמצונית. דרכי פינוי החנקן מהגוף, מעגל האוראה, שילוב חומצות אמינו במעגל קרבס. רמה,,, ו,,,,,
60 אינטגרציה של המערכות: מסלולים מטבוליים בכבד, בלב, בשריר ובמוח. ספרות (לכל חלקי הקורס) Lehninger, Principles of Biochmistry. R. Stryer, Biochemistry. האוניברסיטה הפתוחה מבוא למדעי החיים יחידות:,,,5,6,9 האוניברסיטה הפתוחה התא מבנה ופעילות יחידות 5,6,,9,0 האוניברסיטה הפתוחה פרקים בפיסיולוגיה של האדם- יחידות,,,6, האוניברסיטה הפתוחה ביוכימיה I יחידה 6...5.6..